电子加速器与钴60-γ射线在食品加工、消毒灭菌中同属于非热杀菌技术，具有常温常压、无损伤、无残毒、环保、低能耗、运行操作简便、自动化程度高、适宜于大规模工业化生产等共同特点。
与钴源相比，加速器的优点主要包括：
1、产生的电子束是定向发射，辐照束流集中定向，能源利用更充分。
2、处理效率高。在相同的功率情况下，单位时间加速器辐照处理的物品数量是γ射线处理量的2.8～3倍，能为实际生产节省更多的流转时间。
3、调节改变辐射剂量更方便。加速器可以通过调整传送带的速度迅速改变辐照剂量，在切换处理不同产品时，更为灵活方便，提高生产效率。
4、电子加速器是机械源，可通过关闭电源停止射线的产生，更环保安全节能。
加速器的缺点主要包括：
1、加速器的电子束穿透能力较弱，在辐照加工过程中对产品的密度，包装尺寸要求较高，适合低密度或薄包装的产品。处理同样量的产品，需要更多的包装箱，增加成本。而钴60-γ射线在包装、密度上则基本不受限制。
2、γ射线辐照剂量率比较低，而电子束剂量率比较高，高剂量率容易使某些聚合物的质量恶化。
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